花園法皇さまが妙心寺に隣接して創建した建物です。法皇さまと開山さまは、ここで問答を行い、禅の教えを深められました。

内陣には花園法皇さまの木像が祀られています。また玉鳳院の北東には、豊臣秀吉の子・棄丸のお霊屋があります。